Был курсантом Оренбургского военного лётного училища. В июле 1943 года стал командиром экипажа ночного бомбардировщика 219 авиационного бомбардировочного полка 36 авиационной дивизии. Был награждён орденом Красного Знамени. В феврале 1944 года получил орден Отечественной войны I степени. Участвовал в боях на Западном, Юго-Западном, Волховском фронтах и в Заполярье. В ночь с 27 на 28 марта 1944 года звену Ванякина приказано блокировать аэродром истребителей противника под Салмиярви (в северной Финляндии), в то время как основные силы полка будут наносить удар по порту Киркинес. Задание было выполнено, но на аэродром самолёт не вернулся. Вместе со стрелком Ванякин попал в концентрационный лагерь Ходау (Чехословакия), где их обнаружили в первых числах мая 1945 года. Было отобрано 18 тысяч человек, которые могли самостоятельно передвигаться. Их построили в колонны и вывели из лагеря, а больных оставили в заминированном лагере, в том числе и Ванякина. Взорвать лагерь немцам не удалось. 7 мая 1945 года узники были освобождены. Позже оставшиеся в живых узнали, что все 18 тысяч человек пленных, выведенных из лагерей, были расстреляны отступающими войсками "СС". Вернувшись в Куйбышев, Семен Ванякин пошел работать лаборантом в авиационный институт. Стал студентом там же. Закончил вуз, затем долго работал старшим преподавателем на кафедре "Конструкции летательных аппаратов" и заведующим заочным отделением института. Источник - Научный полк Самарского политеха.