Университет основан в 1958 году как Владивостокский медицинский институт по Постановлению Совета Министров РСФСР №905. Изначально вуз готовил специалистов по трём направлениям: «лечебное дело», «медико-профилактическое дело» и «педиатрия».
Сегодня ТГМУ продолжает непрерывную подготовку медицинских кадров от довузовских программ (среднее и основное общее образование) до высшего и среднего профессионального образования. Принцип «Образование через всю жизнь» реализуется через ординатуру, аспирантуру и программы дополнительного профессионального образования.
При университете действует Учебный военный центр. ТГМУ – ведущий образовательный и научный центр Дальнего Востока, проводящий исследования в области медицины, биологии, психологии, химии и экономики здравоохранения. Работают три диссертационных совета.
Проект «Лица Победы» собрал для ознакомления семейные истории о героях.